审计发现，现阶段相当一部分行政事业单位存在财务管理和会计基础工作薄弱，内控制度不健全，风险控制缺位等问题。基本现状是三个缺乏：一是领导缺乏内部控制意识。对建立健全单位内部控制的重要性认识不够,认为可有可无；或简单认为财政的部门预算控制、部门的会计核算片面就等同于内部控制。二是部门缺乏内部控制手段。一些单位的负责人仅把财会部门当成“钱袋子”,会计人员当成“付款员”,财会部门无权参与单位的重要决策乃至业务管理活动,对单位重要决策的过程和结果均不了解。三是会计人员缺乏内部控制能力。在历经自行核算、会计集中核算，国库集中收付及核算后，除极少数单位原保留的会计人员重操旧业，绝大部份的会计人员或退或调转，人员不足，知识老化，缺乏全面财务监管能力，内部控制基本流于形式。基于审计的角度，行政事业单位内部控制制度要得到有效执行，必须加强以下四个环节的控制。

一、收入环节控制

控制点是要确保单位的所有资金流入都在财务掌控中。

（一）严格票据管理。一是必须设立财政票据购领台账，下设收费员的部门还要设立部门票据领销台账，做到来龙去脉清晰，责任划分清楚。二是收款后必须及时缴入财政非税专户，然后会计（或其他指定审核人）凭出纳（或其他收款人员）提交的银行进账单在收据上盖单，以规避大头小尾行为发生。抓住票据这个牛鼻子管好收入第一关。

（二）加强暂付应收等往来管理。单位财务人员必须注重对暂付应收等往来科目的清理。所有购销及借款、资产租赁合同均应由财务人员使用台账进行管理，按约定时间及时催收。对差旅费、培训费等借款在一个月内完成清缴，对其他暂付往来款项年底进行清理催缴，以防形成呆账死账。

二、支出环节控制

控制点是要从职位设置、审批程序上进行全程控制。

（一）政策宣传到位。财务人员要及时做好各项财经法规及管理规定的汇报及宣传告知工作，制定本单位各项管理规定并严格执行，做到深入人心，促使遵守制度的自觉性。

（二）事前控制到位。对单位的建设和发展产生重大影响而且资金量较大的重大财务事项应由班子成员进行集中决策，财务分管领导或财务负责人须参与经济事项的筹划及决策，认真评估法律、政策规定风险，提出建议。为防止个人决策或随意更改集体决策，决策过程及各方面意见要形成书面文件并汇同会议记录，联同其他相关文件存档备查。

（三）事中控制到位。一是对各种超预算、超标准、超范围的经费支出予以提醒并拒绝办理;二是对属于政府采购标准及范围的开支，予以提醒并要求办理审批程序；三是对各种外来财务票据的真实性、合法性、完整性进行审核，杜绝假发票、虚列开支的违规行为。四是严格按项目进度支付工程款，凭正规建安发票支付进度款，坚决杜绝白条借支，以规避开发商不办理结算，不开具正规发票的风险。